1、气流组织
百级手术室的手术区域采用挤压原理，静压箱的外部尺寸≥2400mm×2600mm。箱内满布高效低阻无隔板高效过滤器，底部设有送风扩散孔扳，气流为上送下回的层流气流组织形式。万级手术室净化采用填充原理，其静压箱外形的尺寸为≥1 400 mm×2 600 mm，箱内布高效低阻无隔板高效过滤器，底部设有送风扩散孔扳，气流为上送下回的低紊流气流组织形式。洁净的走廊及其辅助室使用高效的出风口供应空气，气流应为上下流动的紊流气流形式，清洁污物走廊可采用高效或亚高效送风口送风，气流宜为上送上回风的乱流气流组织形式。采用的是稀释原理。无影灯对手术室净化过程中，上方的送风气流有阻挡影响，为保证送风气流能在手术创口周围形成良好的洁净无菌区域，选择气流阻挡系数小的流线型等无影灯。
2、空气过滤系统
空气过滤是一种有效，安全，经济和方便的灭菌方法。过滤器是确保室内清洁的重要因素。过滤器分为初效、中效、亚高效、高效4种级别。通过由低到高级别过滤器的串联形成完整的空气过滤系统。净化空调系统至少应设置初、中、高效三级过滤。
常规上，手术室净化空调单元的第一级初级过滤器设置在新鲜空气出口处，以过滤室外空气中的大颗粒灰尘，第二级中效过滤器设置在系统的正压段，有利于防止污染空气渗入净化系统；第三级高效过滤器设置在系统的末端（室内天花），利于保证室内空气的洁净度。
单独设置新风机组替代上述第一级过滤，机组设初、中、亚高效三级过滤，对保护手术室净化循环空调系统具有良好的作用。 专为新风机组设置了方便更换的前置过滤装置提高了可操作性。在回风口安装中效过滤器是基于以下考虑：手术室净化人员的活动以及手术前后的清洁可能导致回风中包含更多的杂质，例如头发和纺织纤维，容易沉积在回风管路或盘管上，引起积尘孳菌，影响传热效率，降低风量，甚至发生堵塞，同时增加高效过滤器的负担。
3、正压控制
手术室净化过程中，应相对于周围区域保持正压，压力应从洁净区域到污染区域，从高清洁度逐渐降低到低清洁度，形成有序的压力梯度和定向气流，防止外界污染空气侵入以及低级别环境对高级别的影响。
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